skip to Main Content
Claudia Coronnello
Claudia Coronnello, PhD
Principal Investigator in Advanced Data Analysis
ccoronnello@fondazionerimed.com

Cenni biografici

La Dott.ssa Claudia Coronnello si é laureata in Fisica all’Università degli Studi di Palermo nel 2002. Negli anni 2003-2004 ha preso parte al progetto “Te.S.C.He.T – Technology System for Cultural Heritage and Tourism”, come giovane “talento” presso l’ISUFI di Lecce. Nel 2005, ha preso parte al progetto Europeo Strep intitolato “Dysonet -Human behavior through dynamics of complex social networks: an interdisciplinary approach” presso l’Università degli Studi di Palermo. Nel 2008 riceve il titolo di Dottore di Ricerca in Fisica Applicata all’Università di Palermo, sviluppando un progetto dal titolo “Gene Ontology statistical analysis of complex diseases: methodological issues and application to Autism”.

Nel 2009 prende parte, nel ruolo di Bioinformatico, al progetto PERFORMANCE, presso l’Istituto Mediterraneo per i Trapianti e Terapie ad Alta Specializzazione (ISMETT) a Palermo. Alla fine del 2009, entra a far parte della squadra RiMED, venendo ospitata, inizialmente, presso due enti di ricerca internazionali: nel periodo 2010-2012 si è unita al laboratorio del Dott. Benos presso il Dipartimento di Computational and Systems Biology dell’Università di Pittsburgh, PA; nel periodo 2013-2017 si è unita al gruppo della Dott.ssa Giallongo presso l’IRIB-CNR a Palermo. A partire dal 2018 è Responsabile del gruppo Advanced Data Analysis della Fondazione Ri.MED.

Attività Scientifica

Al centro dell’attività di ricerca della Dott.ssa Coronnello vi è lo studio dell’attività dei microRNA da differenti punti di vista. Esplora la loro funzione studiando il comportamento delle proteine del complesso RISC, sviluppa nuovi algoritmi per predire efficientemente i target dei microRNA e studia i network di interazione biologica tra i microRNA e i loro target. In particolare, analizza dati di trascrittomica caratterizzanti le frazioni immunoprecipitate (IP) con due proteine del complesso RISC (AGO2 e GW182), per comprendere il loro ruolo nell’attività dei microRNA; utilizza i geni differenzialmente espressi nella IP di AGO2 e nell’inibizione di AGO2 per istruire algoritmi di predizione di target di set di microRNA (e.g., ComiR); utilizza i profili di espressione genica di mRNA e microRNA per dedurre le interazioni biologiche tra essi. Dal momento che i microRNA sono coinvolti nei tumori e in altre malattie terminali, i suoi algoritmi possono fornire validi strumenti per future applicazioni di microRNA nella pratica clinica.

La Dott.ssa Coronnello è esperta in analisi di dati omici, a partire dal preprocessing dei dati grezzi fino all’interpretazione dei risultati, e condivide la sua attività sviluppando algoritmi per l’analisi dei dati, dove viene integrata l’informazione proveniente da differenti sorgenti di dati e tecniche sperimentali. Al momento, è autrice di 35 articoli su riviste internazionali peer-reviewed (Scopus h-index: 13).

Pubblicazioni

Journal Paper
Regulatory role of lncH19 in RAC1 alternative splicing: implication for RAC1B expression in colorectal cancer
Aurora Cordaro , Maria Magdalena Barreca , Chiara Zichittella , Marco Loria , Denise Anello , Goffredo Arena , Nicolina Sciaraffa, PhD , Claudia Coronnello, PhD , Giuseppe Pizzolanti , Riccardo Alessandro , Alice Conigliaro
J Exp Clin Cancer Res 43, 217
https://doi.org/10.1186/s13046-024-03139-z
Journal Paper
Caspase-8 activation by cigarette smoke induces pro-inflammatory cell death of human macrophages exposed to lipopolysaccharide
Marta Cristaldi , Marco Buscetta, PhD , Maura Cimino , Agnese La Mensa, PhD , Maria Rita Giuffrè , Luigi Fiore , Claudia Carcione , Fabio Bucchieri , Francesca Rappa , Claudia Coronnello, PhD , Nicolina Sciaraffa, PhD , Santina Amato , Tommaso Silvano Aronica , Giovanna Lo Iacono , Alessandro Bertani , Elisabetta Pace , Chiara Cipollina, PhD ,
Cell Death Dis, 2023 Nov 25;14(11):773.
https://doi.org/10.1038/s41419-023-06318-6
Journal Paper
miRNA expression analysis in the human heart: Undifferentiated progenitors vs. bioptic tissues—Implications for proliferation and ageing
Gioacchin Iannolo , Maria Rita Sciuto , Nicola Cuscino , Claudia Carcione , Claudia Coronnello, PhD , Cinzia Chinnici, PhD , Giuseppe Maria Raffa , Michele Pilato , Pier Giulio Conaldi
Journal of Cellular and Molecular Medicine25(18):8687-8700, 2021
https://doi.org/10.1111/jcmm.16824
Journal Paper
Cross-talk between Colon Cells and Macrophages Increases ST6GALNAC1 and MUC1-sTn Expression in Ulcerative Colitis and Colitis-Associated Colon Cancer
Kvorjak M , Ahmed Y , Miller ML , Sriram R , Claudia Coronnello, PhD , Hashash JG , Hartman DJ , Telmer CA , Miskov-Zivanov N , Finn OJ , Cascio S *
Cancer Immunol Res. 2020 Feb;8(2):167-178. doi: 10.1158/2326-6066.CIR-19-0514. Epub 2019 Dec 12.
https://aacrjournals.org/cancerimmunolres/article/8/2/167/469841/Cross-talk-between-Colon-Cells-and-Macrophages
Journal Paper
Usefulness of regional right ventricular and right atrial strain for prediction of early and late right ventricular failure following a left ventricular assist device implant: A machine learning approach
Diego Bellavia , Attilio Iacovoni , Valentina Agnese , Calogero Falletta , Claudia Coronnello, PhD , Salvatore Pasta , Giuseppina Novo , Gabriele di Gesaro , Michele Senni , Joseph Maalouf , Sergio Sciacca , Michele Pilato , Marc Simon , Francesco Clemenza , Sir John Gorcsan III
The International Journal of Artificial Organs 43(5): 297-314, 2020
https://doi.org/10.1177/0391398819884941
Journal Paper
On the prospect of serum exosomal miRNA profiling and protein biomarkers for the diagnosis of ascending aortic dilatation in patients with bicuspid and tricuspid aortic valve
Alessia Gallo , Valentina Agnese , Claudia Coronnello, PhD , Giuseppe M. Raffa , Diego Bellavia , Pier Giulio Conaldi , Michele Pilato , Salvatore Pasta
International Journal of Cardiology273:230-236, 2018
https://doi.org/10.1016/j.ijcard.2018.10.005
Journal Paper
Novel modeling of combinatorial miRNA targeting identifies SNP with potential role in bone density
Claudia Coronnello, PhD , Ryan Hartmaier , Arshi Arora , Luai Huleihel , Kusum V. Pandit , Abha S. Bais , Michael Butterworth , Naftali Kaminski , Gary D. Stormo , Steffi Oesterreich , Panayiotis V. Benos
PloS Computational Biology8(12):e1002830, 2012
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002830
Back To Top