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Piattaforma di Biologia Strutturale e Biofisica

Descrizione

La piattaforma di Biologia Strutturale e Biofisica fornisce supporto per l’identificazione di target, la scoperta di potenziali farmaci basati su piccole molecole, e lo sviluppo di terapie a base di proteine ​​con particolare attenzione agli anticorpi terapeutici.

La piattaforma è dotata di apparecchiature all’avanguardia che consentono un approccio multi-tecnica, come la risonanza magnetica nucleare, il dicroismo circolare, la calorimetria e l’interferometria. Le tecnologie disponibili consentono di chiarire la relazione struttura/funzione di proteine di interesse, nonché studi strutturali, cinetici e termodinamici delle interazioni proteina-proteina e proteina-ligando.

La Piattaforma supporta diversi progetti di ricerca in varie aree terapeutiche quali neurodegenerazione, cancro e malattie infettive. La diversità di tutti i progetti di ricerca ben rappresenta il potenziale della Biologia Strutturale e Biofisica che può essere applicata sia alla ricerca di base che a quella traslazionale e può supportare trasversalmente diverse attività di ricerca.

Competenze

  • Produzione di proteine ricombinanti: dal clonaggio alla purificazione e caratterizzazione;
  • Determinazione delle dimensioni, della struttura e della stabilità di macromolecole;
  • Studi strutturali, cinetici e termodinamici di interazioni proteina-proteina e proteina-ligando;
  • BLI-based and NMR-based fragment screening;
  • Sviluppo e applicazione di metodi analitici customizzati.

Dotazione Tecnologica

  • Laboratori di biologia molecolare per la produzione di proteine ricombinanti secondo le più moderne tecniche di clonaggio, espressione e purificazione;
  • Avance Neo 800 MHz NMR Spettrometro equipaggiato con cryo-probe, Bruker;
  • MicroCal PEAQ_ITC, Malvern Panalytical;
  • Bio-Layer Interferometer Octet Red96e, Sartorious;
  • Spectropolarimeter J-1500, JASCO;
  • Multi-mode high-performance Microplate Reader CLARIOstar Plus, BMG Labtech.

Contatti:

calfano@fondazionerimed.com

Collaborazioni:

  • King’s College London, Londra, Regno Unito
  • Fondazione EBRI Rita Levi Montalcini, Roma, Italia
  • Università degli studi della Campania “Luigi Vanvitelli”, Napoli, Italia
  • Università degli Studi di Palermo, Italia
  • Istituto di Biofisica (IBF-CNR), Palermo, Italia
  • International Covid-19 NMR Consortium
  • Istituto di Nanotecnologia (CNR NANOTEC), Lecce, Italia
  • i3S Institute for Research and Innovation in Health, Porto, Portogallo

Pubblicazioni

Journal Paper
Investigation on a MMACHC mutant from cblC disease: The c.394C>T variant
Rosa Passantino , Maria Rosalia Mangione , Maria Grazia Ortore , Maria Assunta Costa , Alessia Provenzano , Heinz Amenitsch , Raffaele Sabbatella , Caterina Alfano, PhD , Vincenzo Martorana , Silvia Vilasi
Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics, 1870(6):140793, 2022
https://doi.org/10.1016/j.bbapap.2022.140793
Journal Paper
Computational design and characterization of a multiepitope vaccine against carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae strains, derived from antigens identified through reverse vaccinology
Nicola Cuscino , Ayesha Fatima , Vincenzo Di Pilato , Matteo Bulati , Caterina Alfano, PhD , Elisa Monaca , Giuseppina Di Mento , Daniele Di Carlo , Francesca Cardinale , Francesco Monaco , Gian Maria Rossolini , Asif M. Khan , Pier Giulio Conaldi ,
Computational and Structural Biotechnology Journal, 20:4446-4463, 2022
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.08.035
Journal Paper
ETV6-related thrombocytopenia: dominant negative effect of mutations as common pathogenic mechanism
Michela Faleschini , Daniele Ammeti , Nicole Papa , Caterina Alfano, PhD , Roberta Bottega , Giorgia Fontana , Valeria Capaci , Melania E. Zanchetta , Federico Pozzani , Francesca Montanari , Valeria Petroni , Paola Giordano , Patrizia Noris , Fiorina Giona , Anna Savoia
Haematologica, 107(9):2249-2254, 2022
https://doi.org/10.3324/haematol.2022.280729
Journal Paper
Backbone chemical shift spectral assignments of SARS coronavirus-2 non-structural protein nsp9
Erika F. Dudás , Rita Puglisi , Sophie Marianne Korn , Caterina Alfano, PhD , Maria Laura Bellone , Fabrizio Dal Piaz , Geoff Kelly , Elisa Monaca , Andreas Schlundt , Harald Schwalbe , Annalisa Pastore
Biomolecular NMR Assignments, 15(2):235-241, 2021
https://doi.org/10.1007/s12104-021-10011-0
Journal Paper
Large-scale recombinant production of the SARS-CoV-2 proteome for high-throughput and structural biology applications
Nadide Altincekic , Sophie Marianne Korn , Nusrat Shahin Qureshi , Marie Dujardin , Martí Ninot-Pedrosa , Rupert Abele , Marie Jose Abi Saad , Caterina Alfano, PhD , ... , Elisa Monaca , ... , Raffaele Sabbatella , ... , Andreas Schlundt
Frontiers in Molecular Biosciences, 8:653148, 2021
https://doi.org/10.3389/fmolb.2021.653148
Journal Paper
Recombinant mussel protein Pvfp-5β: a potential tissue bioadhesive
Radha Santonocito , Francesca Venturella , Fabrizio Dal Piaz , Maria Agnese Morando, PhD , Alessia Provenzano , Estella Rao , Maria Assunta Costa , Donatella Bulone , Pier Luigi San Biagio , Daniela Giacomazza , Alessandro Sicorello , Caterina Alfano, PhD *, Rosa Passantino *, Annalisa Pastore
Journal of Biological Chemistry, 294(34):12826-12835, 2019
https://doi.org/10.1074/jbc.RA119.009531
Journal Paper
RNA as a key factor in driving or preventing self-assembly of the TAR DNA-binding protein 43
Elsa Zacco , Ricardo Graña-Montes , Stephen R. Martin , Natalia Sanchez de Groot , Caterina Alfano, PhD , Gian Gaetano Tartaglia , Annalisa Pastore
Journal of Molecular Biology, 431(8):671-1688, 2019
https://doi.org/10.1016/j.jmb.2019.01.028
Journal Paper
Thrombopoietin mutation in congenital amegakaryocytic thrombocytopenia treatable with romiplostim
Alessandro Pecci , Iman Ragab , Valeria Bozzi , Daniela De Rocco , Serena Barozzi , Tania Giangregorio , Heba Ali , Federica Melazzini , Mohamed Sallam , Caterina Alfano, PhD , Annalisa Pastore , Carlo Luigi Balduini , Anna Savoia
EMBO Molecular Medicine, 10(1):63-75, 2018
https://doi.org/10.15252/emmm.201708168
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